刘小云，北京大学基础医学院病原生物学系研究员，博士生导师。曾获国家青年千人计划和优秀青年基金资助，目前担任中国质谱学会学术委员、中国蛋白质组学专委会常务委员、中国化学会质谱分析专委会和色谱专委会委员、中国生物物理学会肠道菌群分会理事、国际蛋白质组学权威期刊 J Proteome Res 编委等职。课题组致力于发展和运用高通量蛋白质组学技术研究人类重要病原菌与宿主互作的分子机理，发现了一系列细菌毒力因子催化的全新蛋白质翻译后修饰，包括磷酸胆碱修饰，单酶催化的泛素化，新型ADP核糖基化和磷酰基腺苷酸化修饰。以通讯作者（含共同）在 Nature，Nat Microbiol，Mol Cell，Nat Commun，Cell Rep，Mol Cell Proteomics，J Proteome Res 等期刊发表论文90余篇。

Email: xiaoyun.liu@bjmu.edu.cn

教育经历：

2003-07 至 2009-01, 印第安那大学, 分析化学, 博士

2001-07 至 2003-06, 密歇根州立大学, 分析化学, 硕士

1997-09 至 2001-06, 吉林大学, 化学, 学士

工作经历：

2019-04 至 今, 北京大学, 基础医学院病原生物学系, 研究员

2012-09 至 2019-03, 北京大学, 化学与分子工程学院, 研究员

2009-03 至 2012-08, 耶鲁大学医学院病原生物学系

获得奖励

1. 2021年度中国重要医学进展（第二完成人） 2022年

2. 国家优秀青年科学基金  2016年

3. 中组部青年千人计划  2013年

研究概述：

现今传染病仍时刻威胁人类健康，我们课题组面向细菌感染性疾病，发展并运用高通量蛋白质组学策略研究病原菌致病的分子机制。我们重点关注一类具有特殊分泌系统的革兰氏阴性致病菌，如引起肠炎的鼠伤寒沙门氏菌。沙门氏菌可侵染非吞噬性细胞（如肠上皮细胞），进而在宿主细胞内存活并增殖。这类病原菌的致病力（或称毒力）通常严格依赖于细菌表面一种类似注射器的超分子结构-三型分泌系统。在感染过程中细菌可通过该装置在宿主质膜上打孔进而将毒力蛋白（或称效应蛋白）直接转运至宿主胞内，从而介导病原菌感染中的一些重要生理、生化过程。这些效应蛋白通常靶向特定的宿主因子，通过精准调控宿主靶标的生物学功能最终实现逃逸免疫应答并促进细菌感染和体内增殖的目的。我们以生物质谱为核心，围绕人类重要致病菌与宿主互作的分子机制，主要取得了以下重要进展：

1. 发展深度胞内菌定量蛋白质组技术并阐明了病原菌适应宿主的分子机制。

2. 建立高精度质谱解析方法并破译了一系列细菌毒力因子催化的全新蛋白质修饰。

在研项目：

1. 科技部国家重点研发计划项目，2022YFA1304500，面向细胞间通讯的化学生物学新技术及其在肿瘤免疫研究中的应用，2023/01-2027/12，160万元，在研，参与

2. 国家自然科学基金面上项目, 22174003，泛素化修饰组学新方法发展及其在病原菌-宿主互作中的应用研究，2022/01-2025/12，60万元，在研，主持

代表性文章：

1. Wang T, Song X, Tan J, Xian W, Zhou X, Yu M, Wang X, Xu Y, Wu T, Yuan K, Ran Y, Yang B, Fan G, Liu X*, Zhou Y*, Zhu Y*. (2024)  Legionella  effector LnaB is a phosphoryl-AMPylase that impairs phosphosignaling.  Nature , in press.

2. Xian W, Fu J, Zhang Q, Li C, Zhao YB, Tang Z, Yuan Y, Wang Y, Zhou Y, Brzoic PS, Zheng N, Ouyang S, Luo ZQ*, Liu X*. (2024) The  Shigella kinase effector OspG modulates host ubiquitin signaling to escape septin-cage entrapment.  Nat. Commun. , 15, 3890.

3. Zhang Q, Xian W, Li Z, Lu Q, Chen X, Ge J, Tang Z, Liu B, Chen Z, Gao X, Hottiger MO, Zhang P*, Qiu J*, Shao F, Liu X*. (2024)  Shigella induces stress granule formation by ADP-riboxanation of the eIF3 complex.  Cell Rep. , 43, 113789.

4. Yan Y, Xiao J, Huang F, Xian W, Yu B, Cheng R, Wu H, Lu X, Wang X, Oyejobi GK, Robinson CV, Wu H, Wu D*, Liu X*, Wang L*, Zhu B*. (2024) Phage defense system CBASS is regulated by a prokaryotic E2 enzyme that imitates the ubiquitin pathway.  Nat. Microbiol. , in press.

5. Yuan Y, Wang X, Jin J, Tang Z, Xian W, Zhang X, Fu J*, He K*, Liu X*. (2023) The  Salmonella Typhimurium effector SpvB subverts host membrane trafficking by targeting clathrin and AP-1.  Mol. Cell. Proteomics , 22, 100674.

6. Jin J, Yuan Y, Xian W, Tang Z, Fu J, Liu X*. (2023) The ever increasing necessity of mass spectrometry in dissecting protein post-translational modifications catalyzed by bacterial effectors.  Mol. Microbiol. , 119, 677-686.

7. Ge J, Wang Y, Yu K, Luo ZQ, Liu X*, Qiu J*. (2023) Phosphoribosyl-linked serine ubiquitination of USP14 by the SidE family effectors of  Legionella excludes p62 from the bacterial phagosome.  Cell Rep. , 42, 112817.  

8. Li Z, Liu W, Fu J, Cheng S, Xu Y, Wang Z, Liu X, Shi X, Liu Y, Qi X, Liu X*, Ding J, Shao F*. (2021)  Shigella  evades pyroptosis by arginine ADP-riboxanation of caspase-11.  Nature , 599, 290-295.

9. Niu Y, Yang L, Gao T, Dong C, Zhang B, Yin P, Hopp AK, Li D, Gan R, Wang H, Liu X, Cao X, Xie Y, Meng X, Deng H, Zhang X, Ren J, Hottiger MO, Chen Z*, Zhang Y*, Liu X*, Feng Y*. (2020) A type I-F anti-CRISPR protein inhibits the CRISPR-Cas surveillance complex by ADP-ribosylation.  Mol. Cell , 80, 512-524.

10.  Wang Z, McCloskey A, Cheng S, Wu M, Xue C, Fu J, Liu Y, Luo ZQ*, Liu X*. (2018) Regulation of the small GTPase Rab1 function by a bacterial glucosyltransferase.  Cell Discov.  , 4, 53.