《医学寄生虫学》是研究感染人的寄生虫和寄生虫病的学科，内容包括医学原生动物、医学蠕形动物和医学节肢动物，是病原生物学领域的一个重要分支，与基础医学、临床医学、预防医学、医学检验等密切相关，是相关专业的本科必修课程。本课程以在我国及世界流行且危害较大的常见寄生虫和传播媒介为学习重点，学习以其形态、生活史和生态、寄生虫与宿主及外界环境之间的相互作用、实验诊断为基本内容，并注重流行的主要因素和防治的主要原则。

寄生虫学教研室承担全校不同专业和学制的《医学寄生虫学》的理论和实验教学工作，同时面向全校师生开设选修课程《生活中的寄生虫》。教研室多人次主编和参编多部国家级规划教材，主持研制了《医学寄生虫学计算机多媒体课件》，深受其他院校师生好评并获得卫生部高教司嘉奖。教研室也曾多次获得北京大学及基础医学院教学优秀集体奖，多人次获得北京大学医学部及基础医学院教学优秀奖、教学管理优秀奖、教改优秀教师奖、创新人才指导优秀教师奖等奖项。