1986年河北省某县发生病因未明的肝炎流行，庄辉接受卫生部委派，与中国食品药品鉴定所、中国预防医学科学院 (现中国疾病预防控制中心) 和河北省卫生防疫站 (现河北省疾病预防控制中心) 的有关专家一起，深入现场调查，通过病原学、血清学、分子生物学和流行病学等研究，首次证实是经血传播的非甲非乙型肝炎 (即丙型肝炎) 流行，与单采血浆过程中交叉污染有关，采取相应措施后流行得到了控制。为了确认病原体，庄辉教授还研制出了我国最早的丙型肝炎诊断试剂。庄辉教授的这些贡献先后获河北省科技进步一等奖、卫生部科技进步三等奖和教育部科技进步奖二等奖各1项。